caa a22 4500 445807172 CHVBK 20180317145200.0 cr unu---uuuuu 170323e20110101xx s 000 0 eng 10.1007/s00415-010-5682-5 doi (NATIONALLICENCE)springer-10.1007/s00415-010-5682-5 Molecular diagnosis of known recessive ataxias by homozygosity mapping with SNP arrays [Elektronische Daten] [D. H'mida-Ben Brahim, A. M'zahem, M. Assoum, Y. Bouhlal, F. Fattori, M. Anheim, L. Ali-Pacha, F. Ferrat, M. Chaouch, C. Lagier-Tourenne, N. Drouot, C. Thibaut, T. Benhassine, Y. Sifi, D. Stoppa-Lyonnet, K. N'Guyen, J. Poujet, A. Hamri, F. Hentati, R. Amouri, F. Santorelli, M. Tazir, M. Koenig] The diagnosis of rare inherited diseases is becoming more and more complex as an increasing number of clinical conditions appear to be genetically heterogeneous. Multigenic inheritance also applies to the autosomal recessive progressive cerebellar ataxias (ARCAs), for which 14 genes have been identified and more are expected to be discovered. We used homozygosity mapping as a guide for identification of the defective locus in patients with ARCA born from consanguineous parents. Patients from 97 families were analyzed with GeneChip Mapping 10K or 50K SNP Affymetrix microarrays. We identified six families homozygous for regions containing the autosomal recessive spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (ARSACS) gene, two families homozygous for the ataxia-telangiectasia gene (ATM), two families homozygous for the ataxia with oculomotor apraxia type 1 (AOA1) gene, and one family homozygous for the AOA type 2 (AOA2) gene. Upon direct gene testing, we were able to identify a disease-related mutation in all families but one of the two kindred homozygous at the ATM locus. Although linkage analyses pointed to a single locus on chromosome 11q22.1-q23.1 for this family, clinical features, normal levels of serum alpha-foetoprotein as well as absence of mutations in the ATM gene rather suggest the existence of an additional ARCA-related gene in that interval. While the use of homozygosity mapping was very effective at pointing to the correct gene, it also suggests that the majority of patients harbor mutations either in the genes of the rare forms of ARCA or in genes yet to be identified. Springer-Verlag, 2010 Recessive ataxia nationallicence Homozygosity mapping nationallicence SNP microarrays nationallicence H'mida-Ben Brahim D. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut M'zahem A. Centre Hospitalo-Universitaire Ben Badis, Constantine, Algeria aut Assoum M. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut Bouhlal Y. Institut de Neurologie, Tunis, Tunisia aut Fattori F. Molecular Medicine and Neurosciences IRCCS Bambino Gesù Hospital, Rome, Italy aut Anheim M. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut Ali-Pacha L. Service de Neurologie, Centre Hospitalo-Universitaire Mustapha, Alger, Algeria aut Ferrat F. Service de Neurologie, Etablissement Hospitalier Spécialisé de Ben Aknoun, Alger, Algeria aut Chaouch M. Service de Neurologie, Etablissement Hospitalier Spécialisé de Ben Aknoun, Alger, Algeria aut Lagier-Tourenne C. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut Drouot N. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut Thibaut C. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut Benhassine T. Institut Pasteur, Alger, Algeria aut Sifi Y. Centre Hospitalo-Universitaire Ben Badis, Constantine, Algeria aut Stoppa-Lyonnet D. Institut Curie, Service de Génétique, INSERM U830, 75248, Paris, France aut N'Guyen K. Hôpitaux Universitaires de Marseille, Marseille, France aut Poujet J. Hôpitaux Universitaires de Marseille, Marseille, France aut Hamri A. Centre Hospitalo-Universitaire Ben Badis, Constantine, Algeria aut Hentati F. Institut de Neurologie, Tunis, Tunisia aut Amouri R. Institut de Neurologie, Tunis, Tunisia aut Santorelli F. Molecular Medicine and Neurosciences IRCCS Bambino Gesù Hospital, Rome, Italy aut Tazir M. Service de Neurologie, Centre Hospitalo-Universitaire Mustapha, Alger, Algeria aut Koenig M. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut Journal of Neurology Springer-Verlag 258/1(2011-01-01), 56-67 0340-5354 258:1<56 2011 258 415 https://doi.org/10.1007/s00415-010-5682-5 text/html Onlinezugriff via DOI 1 research-article jats NATIONALLICENCE 856 40 https://doi.org/10.1007/s00415-010-5682-5 text/html Onlinezugriff via DOI NATIONALLICENCE 700 1- H'mida-Ben Brahim D. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut NATIONALLICENCE 700 1- M'zahem A. Centre Hospitalo-Universitaire Ben Badis, Constantine, Algeria aut NATIONALLICENCE 700 1- Assoum M. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Bouhlal Y. Institut de Neurologie, Tunis, Tunisia aut NATIONALLICENCE 700 1- Fattori F. Molecular Medicine and Neurosciences IRCCS Bambino Gesù Hospital, Rome, Italy aut NATIONALLICENCE 700 1- Anheim M. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Ali-Pacha L. Service de Neurologie, Centre Hospitalo-Universitaire Mustapha, Alger, Algeria aut NATIONALLICENCE 700 1- Ferrat F. Service de Neurologie, Etablissement Hospitalier Spécialisé de Ben Aknoun, Alger, Algeria aut NATIONALLICENCE 700 1- Chaouch M. Service de Neurologie, Etablissement Hospitalier Spécialisé de Ben Aknoun, Alger, Algeria aut NATIONALLICENCE 700 1- Lagier-Tourenne C. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Drouot N. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Thibaut C. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Benhassine T. Institut Pasteur, Alger, Algeria aut NATIONALLICENCE 700 1- Sifi Y. Centre Hospitalo-Universitaire Ben Badis, Constantine, Algeria aut NATIONALLICENCE 700 1- Stoppa-Lyonnet D. Institut Curie, Service de Génétique, INSERM U830, 75248, Paris, France aut NATIONALLICENCE 700 1- N'Guyen K. Hôpitaux Universitaires de Marseille, Marseille, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Poujet J. Hôpitaux Universitaires de Marseille, Marseille, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Hamri A. Centre Hospitalo-Universitaire Ben Badis, Constantine, Algeria aut NATIONALLICENCE 700 1- Hentati F. Institut de Neurologie, Tunis, Tunisia aut NATIONALLICENCE 700 1- Amouri R. Institut de Neurologie, Tunis, Tunisia aut NATIONALLICENCE 700 1- Santorelli F. Molecular Medicine and Neurosciences IRCCS Bambino Gesù Hospital, Rome, Italy aut NATIONALLICENCE 700 1- Tazir M. Service de Neurologie, Centre Hospitalo-Universitaire Mustapha, Alger, Algeria aut NATIONALLICENCE 700 1- Koenig M. Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM/Université de Strasbourg, 67404, Illkirch, France aut NATIONALLICENCE 773 0- Journal of Neurology Springer-Verlag 258/1(2011-01-01), 56-67 0340-5354 258:1<56 2011 258 415 Metadata rights reserved Springer special CC-BY-NC licence nationallicence BK010053 XK010053 XK010000 NATIONALLICENCE NATIONALLICENCE NL-springer