caa a22 4500 445818522 CHVBK 20180317145236.0 cr unu---uuuuu 170323e20110501xx s 000 0 eng 10.1007/s00792-011-0364-5 doi (NATIONALLICENCE)springer-10.1007/s00792-011-0364-5 Characterization of heterotrophic prokaryote subgroups in the Sfax coastal solar salterns by combining flow cytometry cell sorting and phylogenetic analysis [Elektronische Daten] [Hana Trigui, Salma Masmoudi, Céline Brochier-Armanet, Aude Barani, Gérald Grégori, Michel Denis, Sam Dukan, Sami Maalej] Here, we combined flow cytometry (FCM) and phylogenetic analyses after cell sorting to characterize the dominant groups of the prokaryotic assemblages inhabiting two ponds of increasing salinity: a crystallizer pond (TS) with a salinity of 390g/L, and the non-crystallizer pond (M1) with a salinity of 200g/L retrieved from the solar saltern of Sfax in Tunisia. As expected, FCM analysis enabled the resolution of high nucleic acid content (HNA) and low nucleic acid content (LNA) prokaryotes. Next, we performed a taxonomic analysis of the bacterial and archaeal communities comprising the two most populated clusters by phylogenetic analyses of 16S rRNA gene clone library. We show for the first time that the presence of HNA and LNA content cells could also be extended to the archaeal populations. Archaea were detected in all M1 and TS samples, whereas representatives of Bacteria were detected only in LNA for M1 and HNA for TS. Although most of the archaeal sequences remained undetermined, other clones were most frequently affiliated to Haloquadratum and Halorubrum. In contrast, most bacterial clones belonged to the Alphaproteobacteria class (Phyllobacterium genus) in M1 samples and to the Bacteroidetes phylum (Sphingobacteria and Salinibacter genus) in TS samples. The Author(s), 2011 Heterotrophic prokaryote nationallicence Halophiles nationallicence Flow cytometry nationallicence HNA nationallicence LNA nationallicence Solar saltern nationallicence Molecular ecology nationallicence Archaea nationallicence Bacteria nationallicence Trigui Hana Laboratoire de Microbiologie, Faculté des Sciences de Sfax, B.P. 802, 3000, Sfax, Tunisia aut Masmoudi Salma Laboratoire de Microbiologie, Faculté des Sciences de Sfax, B.P. 802, 3000, Sfax, Tunisia aut Brochier-Armanet Céline Aix-Marseille Université, Laboratoire de Chimie Bactérienne (UPR 9043), Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IFR88), CNRS, 31 Chemin Joseph Aiguier, 13402, Marseille Cedex 20, France aut Barani Aude Centre d'Océanologie de Marseille, Plateforme Régionale de Cytométrie pour la Microbiologie, UMS2196, Université de la Méditerranée, 163 avenue de Luminy, Case 901, 13288, Marseille Cedex 09, France aut Grégori Gérald Centre d'Océanologie de Marseille, Laboratoire de Microbiologie, Géochimie et Ecologie Marines, CNRS UMR6117, Université de la Méditerranée, 163 avenue de Luminy, Case 901, 13288, Marseille Cedex 09, France aut Denis Michel Centre d'Océanologie de Marseille, Laboratoire de Microbiologie, Géochimie et Ecologie Marines, CNRS UMR6117, Université de la Méditerranée, 163 avenue de Luminy, Case 901, 13288, Marseille Cedex 09, France aut Dukan Sam Aix-Marseille Université, Laboratoire de Chimie Bactérienne (UPR 9043), Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IFR88), CNRS, 31 Chemin Joseph Aiguier, 13402, Marseille Cedex 20, France aut Maalej Sami Laboratoire de Microbiologie, Faculté des Sciences de Sfax, B.P. 802, 3000, Sfax, Tunisia aut Extremophiles Springer Japan 15/3(2011-05-01), 347-358 1431-0651 15:3<347 2011 15 792 https://doi.org/10.1007/s00792-011-0364-5 text/html Onlinezugriff via DOI 1 research-article jats NATIONALLICENCE 856 40 https://doi.org/10.1007/s00792-011-0364-5 text/html Onlinezugriff via DOI NATIONALLICENCE 700 1- Trigui Hana Laboratoire de Microbiologie, Faculté des Sciences de Sfax, B.P. 802, 3000, Sfax, Tunisia aut NATIONALLICENCE 700 1- Masmoudi Salma Laboratoire de Microbiologie, Faculté des Sciences de Sfax, B.P. 802, 3000, Sfax, Tunisia aut NATIONALLICENCE 700 1- Brochier-Armanet Céline Aix-Marseille Université, Laboratoire de Chimie Bactérienne (UPR 9043), Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IFR88), CNRS, 31 Chemin Joseph Aiguier, 13402, Marseille Cedex 20, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Barani Aude Centre d'Océanologie de Marseille, Plateforme Régionale de Cytométrie pour la Microbiologie, UMS2196, Université de la Méditerranée, 163 avenue de Luminy, Case 901, 13288, Marseille Cedex 09, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Grégori Gérald Centre d'Océanologie de Marseille, Laboratoire de Microbiologie, Géochimie et Ecologie Marines, CNRS UMR6117, Université de la Méditerranée, 163 avenue de Luminy, Case 901, 13288, Marseille Cedex 09, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Denis Michel Centre d'Océanologie de Marseille, Laboratoire de Microbiologie, Géochimie et Ecologie Marines, CNRS UMR6117, Université de la Méditerranée, 163 avenue de Luminy, Case 901, 13288, Marseille Cedex 09, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Dukan Sam Aix-Marseille Université, Laboratoire de Chimie Bactérienne (UPR 9043), Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IFR88), CNRS, 31 Chemin Joseph Aiguier, 13402, Marseille Cedex 20, France aut NATIONALLICENCE 700 1- Maalej Sami Laboratoire de Microbiologie, Faculté des Sciences de Sfax, B.P. 802, 3000, Sfax, Tunisia aut NATIONALLICENCE 773 0- Extremophiles Springer Japan 15/3(2011-05-01), 347-358 1431-0651 15:3<347 2011 15 792 Metadata rights reserved Springer special CC-BY-NC licence nationallicence BK010053 XK010053 XK010000 NATIONALLICENCE NATIONALLICENCE NL-springer