caa a22 4500 475795458 CHVBK 20180406123723.0 cr unu---uuuuu 170329e20000201xx s 000 0 eng 10.1007/s001220050071 doi (NATIONALLICENCE)springer-10.1007/s001220050071 Application of fluorescence-based semi-automated AFLP analysis in barley and wheat [Elektronische Daten] [G. Schwarz, M. Herz, X. Q. Huang, W. Michalek, A. Jahoor, G. Wenzel, V. Mohler] Abstract : Genetic mapping and the selection of closely linked molecular markers for important agronomic traits require efficient, large-scale genotyping methods. A semi-automated multifluorophore technique was applied for genotyping AFLP marker loci in barley and wheat. In comparison to conventional 33P-based AFLP analysis the technique showed a higher resolution of amplicons, thus increasing the number of distinguishable fragments. Automated sizing of the same fragment in different lanes or different gels showed high conformity, allowing subsequent unambigous allele-typing. Simultaneous electrophoresis of different AFLP samples in one lane (multimixing), as well as simultaneous amplification of AFLP fragments with different primer combinations in one reaction (multiplexing), displayed consistent results with respect to fragment number, polymorphic peaks and correct size-calling. The accuracy of semi-automated co-dominant analysis for hemizygous AFLP markers in an F2 population was too low, proposing the use of dominant allele-typing defaults. Nevertheless, the efficiency of genetic mapping, especially of complex plant genomes, will be accelerated by combining the presented genotyping procedures. Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2000 Key words Automated genotyping nationallicence Fluorescence-based DNA analysis nationallicence AFLP nationallicence Barley nationallicence Wheat nationallicence Schwarz G. Technische Universität München, Lehrstuhl für Pflanzenbau und Pflanzenzüchtung, Alte Akademie 12, D-85350 Freising-Weihenstephan, Germany e-mail: mohler@mm.pbz.agrar.tu-muenchen.de Fax: +49-8161-715173, DE aut Herz M. Technische Universität München, Lehrstuhl für Pflanzenbau und Pflanzenzüchtung, Alte Akademie 12, D-85350 Freising-Weihenstephan, Germany e-mail: mohler@mm.pbz.agrar.tu-muenchen.de Fax: +49-8161-715173, DE aut Huang X. Q. Technische Universität München, Lehrstuhl für Pflanzenbau und Pflanzenzüchtung, Alte Akademie 12, D-85350 Freising-Weihenstephan, Germany e-mail: mohler@mm.pbz.agrar.tu-muenchen.de Fax: +49-8161-715173, DE aut Michalek W. Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung, Corrensstrasse 3, D-06466 Gatersleben, Germany, DE aut Jahoor A. Risø National Laboratory, DK-4000 Roskilde, Denmark, DK aut Wenzel G. Technische Universität München, Lehrstuhl für Pflanzenbau und Pflanzenzüchtung, Alte Akademie 12, D-85350 Freising-Weihenstephan, Germany e-mail: mohler@mm.pbz.agrar.tu-muenchen.de Fax: +49-8161-715173, DE aut Mohler V. Technische Universität München, Lehrstuhl für Pflanzenbau und Pflanzenzüchtung, Alte Akademie 12, D-85350 Freising-Weihenstephan, Germany e-mail: mohler@mm.pbz.agrar.tu-muenchen.de Fax: +49-8161-715173, DE aut https://doi.org/10.1007/s001220050071 text/html Onlinezugriff via DOI 1 research-article jats NATIONALLICENCE 856 40 https://doi.org/10.1007/s001220050071 text/html Onlinezugriff via DOI NATIONALLICENCE 700 1- Schwarz G. Technische Universität München, Lehrstuhl für Pflanzenbau und Pflanzenzüchtung, Alte Akademie 12, D-85350 Freising-Weihenstephan, Germany e-mail: mohler@mm.pbz.agrar.tu-muenchen.de Fax: +49-8161-715173, DE aut NATIONALLICENCE 700 1- Herz M. Technische Universität München, Lehrstuhl für Pflanzenbau und Pflanzenzüchtung, Alte Akademie 12, D-85350 Freising-Weihenstephan, Germany e-mail: mohler@mm.pbz.agrar.tu-muenchen.de Fax: +49-8161-715173, DE aut NATIONALLICENCE 700 1- Huang X. Q. Technische Universität München, Lehrstuhl für Pflanzenbau und Pflanzenzüchtung, Alte Akademie 12, D-85350 Freising-Weihenstephan, Germany e-mail: mohler@mm.pbz.agrar.tu-muenchen.de Fax: +49-8161-715173, DE aut NATIONALLICENCE 700 1- Michalek W. Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung, Corrensstrasse 3, D-06466 Gatersleben, Germany, DE aut NATIONALLICENCE 700 1- Jahoor A. Risø National Laboratory, DK-4000 Roskilde, Denmark, DK aut NATIONALLICENCE 700 1- Wenzel G. Technische Universität München, Lehrstuhl für Pflanzenbau und Pflanzenzüchtung, Alte Akademie 12, D-85350 Freising-Weihenstephan, Germany e-mail: mohler@mm.pbz.agrar.tu-muenchen.de Fax: +49-8161-715173, DE aut NATIONALLICENCE 700 1- Mohler V. Technische Universität München, Lehrstuhl für Pflanzenbau und Pflanzenzüchtung, Alte Akademie 12, D-85350 Freising-Weihenstephan, Germany e-mail: mohler@mm.pbz.agrar.tu-muenchen.de Fax: +49-8161-715173, DE aut Metadata rights reserved Springer special CC-BY-NC licence nationallicence BK010053 XK010053 XK010000 NATIONALLICENCE NATIONALLICENCE NL-springer