The contrasting phylodynamics of human influenza B viruses

Verfasser / Beitragende:
[Dhanasekaran Vijaykrishna, Edward C. Holmes, Udayan Joseph, Mathieu Fourment, Yvonne C.F. Su, Rebecca A. Halpin, Raphael T.C. Lee, Yi-Mo Deng, Vithiagaran Gunalan, Xudong Lin, Timothy B. Stockwell, Nadia B. Fedorova, Bin Zhou, Natalie Spirason, Denise Kühnert, Veronika Boskova, Tanja; id_orcid 0000-0001-6431-535X Stadler, Anna-Maria Costa, Dominic E. Dwyer, Q. Sue Huang, Lance C. Jennings, William Rawlinson, Sheena G. Sullivan, Aeron C. Hurt, Sebastian Maurer-Stroh, David E. Wentworth, Gavin J.D. Smith, Ian G. Barr]
Ort, Verlag, Jahr:
2015
Enthalten in:
eLife, 4, p. e05055
Format:
Artikel (online)
ID: 528785508
LEADER caa a22 4500
001 528785508
005 20190908091347.0
007 cr unu---uuuuu
008 180924e201501 xx s 000 0 eng
024 7 0 |a 10.3929/ethz-b-000098273  |2 doi 
024 7 0 |a 10.7554/eLife.05055  |2 doi 
035 |a (ETHRESEARCH)oai:www.research-collecti.ethz.ch:20.500.11850/98273 
245 0 4 |a The contrasting phylodynamics of human influenza B viruses  |h [Elektronische Daten]  |c [Dhanasekaran Vijaykrishna, Edward C. Holmes, Udayan Joseph, Mathieu Fourment, Yvonne C.F. Su, Rebecca A. Halpin, Raphael T.C. Lee, Yi-Mo Deng, Vithiagaran Gunalan, Xudong Lin, Timothy B. Stockwell, Nadia B. Fedorova, Bin Zhou, Natalie Spirason, Denise Kühnert, Veronika Boskova, Tanja; id_orcid 0000-0001-6431-535X Stadler, Anna-Maria Costa, Dominic E. Dwyer, Q. Sue Huang, Lance C. Jennings, William Rawlinson, Sheena G. Sullivan, Aeron C. Hurt, Sebastian Maurer-Stroh, David E. Wentworth, Gavin J.D. Smith, Ian G. Barr] 
506 |a Open access  |2 ethresearch 
520 3 |a A complex interplay of viral, host, and ecological factors shapes the spatio-temporal incidence and evolution of human influenza viruses. Although considerable attention has been paid to influenza A viruses, a lack of equivalent data means that an integrated evolutionary and epidemiological framework has until now not been available for influenza B viruses, despite their significant disease burden. Through the analysis of over 900 full genomes from an epidemiological collection of more than 26,000 strains from Australia and New Zealand, we reveal fundamental differences in the phylodynamics of the two co-circulating lineages of influenza B virus (Victoria and Yamagata), showing that their individual dynamics are determined by a complex relationship between virus transmission, age of infection, and receptor binding preference. In sum, this work identifies new factors that are important determinants of influenza B evolution and epidemiology. 
540 |a Creative Commons Attribution 4.0 International  |u http://creativecommons.org/licenses/by/4.0  |2 ethresearch 
700 1 |a Vijaykrishna  |D Dhanasekaran  |e joint author 
700 1 |a Holmes  |D Edward C.  |e joint author 
700 1 |a Joseph  |D Udayan  |e joint author 
700 1 |a Fourment  |D Mathieu  |e joint author 
700 1 |a Su  |D Yvonne C.F.  |e joint author 
700 1 |a Halpin  |D Rebecca A.  |e joint author 
700 1 |a Lee  |D Raphael T.C.  |e joint author 
700 1 |a Deng  |D Yi-Mo  |e joint author 
700 1 |a Gunalan  |D Vithiagaran  |e joint author 
700 1 |a Lin  |D Xudong  |e joint author 
700 1 |a Stockwell  |D Timothy B.  |e joint author 
700 1 |a Fedorova  |D Nadia B.  |e joint author 
700 1 |a Zhou  |D Bin  |e joint author 
700 1 |a Spirason  |D Natalie  |e joint author 
700 1 |a Kühnert  |D Denise  |e joint author 
700 1 |a Boskova  |D Veronika  |e joint author 
700 1 |a Stadler  |D Tanja; id_orcid 0000-0001-6431-535X  |e joint author 
700 1 |a Costa  |D Anna-Maria  |e joint author 
700 1 |a Dwyer  |D Dominic E.  |e joint author 
700 1 |a Huang  |D Q. Sue  |e joint author 
700 1 |a Jennings  |D Lance C.  |e joint author 
700 1 |a Rawlinson  |D William  |e joint author 
700 1 |a Sullivan  |D Sheena G.  |e joint author 
700 1 |a Hurt  |D Aeron C.  |e joint author 
700 1 |a Maurer-Stroh  |D Sebastian  |e joint author 
700 1 |a Wentworth  |D David E.  |e joint author 
700 1 |a Smith  |D Gavin J.D.  |e joint author 
700 1 |a Barr  |D Ian G.  |e joint author 
773 0 |t eLife  |d Cambridge : eLife Sciences Publications  |g 4, p. e05055  |x 2050-084X 
856 4 0 |u http://hdl.handle.net/20.500.11850/98273  |q text/html  |z WWW-Backlink auf das Repository (Open access) 
908 |D 1  |a Journal Article  |2 ethresearch 
950 |B ETHRESEARCH  |P 856  |E 40  |u http://hdl.handle.net/20.500.11850/98273  |q text/html  |z WWW-Backlink auf das Repository (Open access) 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Vijaykrishna  |D Dhanasekaran  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Holmes  |D Edward C.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Joseph  |D Udayan  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Fourment  |D Mathieu  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Su  |D Yvonne C.F.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Halpin  |D Rebecca A.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Lee  |D Raphael T.C.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Deng  |D Yi-Mo  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Gunalan  |D Vithiagaran  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Lin  |D Xudong  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Stockwell  |D Timothy B.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Fedorova  |D Nadia B.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Zhou  |D Bin  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Spirason  |D Natalie  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Kühnert  |D Denise  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Boskova  |D Veronika  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Stadler  |D Tanja; id_orcid 0000-0001-6431-535X  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Costa  |D Anna-Maria  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Dwyer  |D Dominic E.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Huang  |D Q. Sue  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Jennings  |D Lance C.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Rawlinson  |D William  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Sullivan  |D Sheena G.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Hurt  |D Aeron C.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Maurer-Stroh  |D Sebastian  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Wentworth  |D David E.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Smith  |D Gavin J.D.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 700  |E 1-  |a Barr  |D Ian G.  |e joint author 
950 |B ETHRESEARCH  |P 773  |E 0-  |t eLife  |d Cambridge : eLife Sciences Publications  |g 4, p. e05055  |x 2050-084X 
898 |a BK010053  |b XK010053  |c XK010000 
949 |B ETHRESEARCH  |F ETHRESEARCH  |b ETHRESEARCH  |j Journal Article  |c Open access